碳源（carbonsource）是可為污（廢）水生化處理系統(tǒng)的微生物生長代謝提供營養(yǎng)物的含碳元素化合物，也是微生物或藻類細(xì)胞組成或代謝產(chǎn)物中，用于提供碳框架所需碳的各種物質(zhì)。從釋放碳的角度看，它是指向大氣中釋放碳的過程、附近活動(dòng)或機(jī)制。（一）按照成分情況分類；單一碳源：只含有一種有效碳源成分的碳源。其有效成分為具有單一分子式和分子結(jié)構(gòu)的、且易被微生物利用的有機(jī)化合物，如甲醇、附近乙醇等小分子醇類；甲酸、同城乙酸等小分子有機(jī)酸和有機(jī)酸鹽類；葡萄糖、附近果糖等糖類物質(zhì)。復(fù)合碳源：由兩種或兩種以上的有效碳源成分組成，有效碳源成分之間須兼容且無化學(xué)反應(yīng)、附近不存在風(fēng)險(xiǎn)的碳源。例如通過對一些糖類、農(nóng)產(chǎn)品廢料等進(jìn)行發(fā)酵制成的生物制品，其主要組分是小分子有機(jī)酸、本地醇類、糖類等的生物質(zhì)碳源，就是復(fù)合碳源的一種。

在水產(chǎn)養(yǎng)殖環(huán)境中的作用穩(wěn)固水體菌藻相平衡：碳是藻類十分重要的營養(yǎng)元素，相當(dāng)于是藻類的骨架。向水體中補(bǔ)充含碳源的物質(zhì)能夠補(bǔ)充有機(jī)碳，穩(wěn)固水體菌藻相平衡，進(jìn)而穩(wěn)定水體的pH。例如很多水產(chǎn)養(yǎng)殖池塘中如果水中缺碳，藻類生長緩慢或者不穩(wěn)定，補(bǔ)充像乙酸鈉這樣的碳源，可以為藻類的生長提供必要的碳元素，促進(jìn)藻類的光合作用，增加水中的溶氧量；同時(shí)維持有益微生物在水體中的比例和活性，防止因天氣突變等原因引起水質(zhì)的劇烈變化，起到穩(wěn)定養(yǎng)殖水體生態(tài)環(huán)境的作用。促進(jìn)有益微生物和藻類繁殖：水體中的碳源富含發(fā)酵蛋白、同城氨基酸和還原糖時(shí)，能有助于促進(jìn)有益藻類和微生物的繁殖生長，穩(wěn)定水色。水產(chǎn)養(yǎng)殖中的藻類可以為養(yǎng)殖生物提供氧氣、本地作為食物來源等重要作用，有益微生物則有助于分解水體中的有害物質(zhì)、本地調(diào)節(jié)水體生態(tài)環(huán)境等，所以碳源通過促進(jìn)它們的生長對整個(gè)養(yǎng)殖環(huán)境產(chǎn)生積極影響，如新生成的有益微生物能夠分解殘餌、糞便等，防止水中有機(jī)物的過度積累。